Il New Mexico è uno dei maggiori produttori di peperoncino (Capsicum spp.) negli Stati Uniti, con 51,000 tonnellate di produzione nel 2021 su un'area di 8500 acri con una produttività media di 6 tonnellate/acro secondo il Dipartimento dell'Agricoltura degli Stati Uniti National Servizio di statistica dell'agricoltura. La produttività media è diminuita del 25% in quanto l'area destinata alla produzione di peperoncini è rimasta la stessa. Ciò ha comportato una riduzione dell'attività economica di quasi il 10% nel 2020 rispetto all'anno precedente, da 50.1 milioni di dollari a 44.9 milioni di dollari. Questo significativo calo della produzione totale di peperoncino nello stato ha spronato gli scienziati a nuovi sforzi di modernizzazione volti ad accelerare il guadagno genetico e migliorare la produttività nel programma NMSU Chile Pepper Breeding and Genetics valutando diversi tratti relativi alla resa e al potenziale di resa utilizzando un alto- strumenti di fenotipizzazione del throughput come Tomato Analyzer (TA).
L'architettura del frutto e i tratti correlati alla morfologia sono tra i fattori determinanti della diversità dei frutti e contribuiscono in modo determinante alla resa e al potenziale di resa del peperoncino. Utilizzando il software TA, gli scienziati hanno raccolto dati su una serie di attributi della frutta, tra cui il perimetro della frutta, gli indici di forma, le dimensioni e l'asimmetria in una raccolta di diverse linee di peperoncino valutate nelle condizioni di crescita del New Mexico.
I ricercatori miravano a caratterizzare 105 genotipi di un pannello di diversità di Capsicum costituito da cultivar, linee di allevamento, ecotipi e specie selvatiche appartenenti a 12 diversi tipi di baccello (frutto), per 32 descrittori TA morfometrici. L'analisi gerarchica dei cluster ha raggruppato i genotipi in otto cluster basati sui descrittori TA. Le misure di base, ovvero perimetro, area, larghezza a metà altezza, larghezza massima, altezza a metà larghezza, altezza massima, e altezza curva - erano i descrittori più discriminanti con un contributo massimo alla forma complessiva del frutto.
È stata dimostrata l'utilità dei descrittori TA morfometrici, che sono difficili da misurare attraverso la fenotipizzazione convenzionale. Diverse cultivar con la forma e la morfologia del frutto desiderate sulla base delle analisi dei grappoli sono state raccomandate come linee parentali per l'ibridazione per migliorare la resa nei programmi di allevamento del peperoncino. I risultati che utilizzano l'AT per misurare i tratti correlati alla frutta forniranno una base per studio di associazione su tutto il genoma e la selezione genomica per la resa e i tratti che contribuiscono alla resa nel peperoncino del Nuovo Messico.